2×ligation solution MasterMix
2×DNA連接緩沖液
● 產(chǎn)品組成:
貨號(hào)
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名稱
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規(guī)格
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RTV701
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2×ligation solution MasterMix
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150 μl
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注;按照10μl連接體系計(jì)算,每次使用5μl,可以使用30次。
● 保存:-20℃
● 產(chǎn)品簡(jiǎn)介:
2×ligation solution MasterMix是含有T4 DNA Ligase,ligation buffer的2×MasterMix,實(shí)驗(yàn)時(shí),只需加入片段和載體即可進(jìn)行連接反應(yīng)。
適用于DNA片段和載體DNA的連接以及DNA片段和Linker或Adaptor DNA的連接。
● 注意事項(xiàng)
1.2×ligation solution MasterMix由于含有T4 DNA ligase,使用前冰浴中徹底融化,混勻后使用。
2.為了提高轉(zhuǎn)化效率,轉(zhuǎn)化時(shí)建議所加入連接產(chǎn)物的量不要超過感受態(tài)細(xì)胞體積的10%。
● 使用方法:
一 DNA片段和載體DNA的連接
1)粘性末端的連接
1.反應(yīng)體系:
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10μl體系
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終濃度
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線性載體DNA
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x μl
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10-50 ng
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插入DNA片段
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y μl
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插入片段:載體=1:1-5:1*
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2×ligation solution MasterMix
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5 μl
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1×
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ddH2O
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up to 10 μl
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*:載體與插入片段的摩爾數(shù)比需要優(yōu)化:一般vector:insert在1:1~1:5之間均可得到較好的結(jié)果。用以下公式計(jì)算片段摩爾數(shù):pmol數(shù)= DNA量(ng)/(660×片段bp數(shù))×1000。例如:插入片段2000bp,線性載體為3000bp,如果載體使用量為50ng(0.025pmol),10μl連接體系中vector:insert的摩爾比是1:3,則需要2000bp pmol數(shù)為0.075pmol,插入片段2000bp的使用量為100ng。
2.徹底輕柔混勻后,瞬間離心,將管壁上的溶液收集到管底。
3.反應(yīng)條件:16℃孵育30分鐘。
4.可取5 μl連接產(chǎn)物熱擊轉(zhuǎn)化50 μl感受態(tài)細(xì)胞或取1-2 μl連接產(chǎn)物電擊轉(zhuǎn)化50 μl感受態(tài)細(xì)胞。
注:1)若要提高電轉(zhuǎn)實(shí)驗(yàn)效率,推薦65℃孵育10分鐘或70℃孵育5分鐘以滅活T4 DNA Ligase后,用DNA產(chǎn)物純化試劑盒或氯仿抽提對(duì)連接后的DNA片段進(jìn)行純化后進(jìn)行電擊轉(zhuǎn)化。
2)若要提高轉(zhuǎn)化子數(shù)目,可將連接時(shí)間延長(zhǎng)至1小時(shí)。
2)平末端的連接
1.反應(yīng)體系:
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10μl體系
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終濃度
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線性平末端載體DNA*
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x μl
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10-50 ng
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插入DNA片段
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y μl
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插入片段:載體=1:1-5:1**
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2×ligation solution MasterMix
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5 μl
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1×
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ddH2O
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up to 10 μl
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*:平滑末端的載體與 DNA 片段進(jìn)行連接時(shí),應(yīng)首先將載體進(jìn)行去磷酸化處理,以防止其自身環(huán)化。
**:載體與插入片段的摩爾數(shù)比需要優(yōu)化:一般vector:insert在1:1~1:5之間均可得到較好的結(jié)果。用以下公式計(jì)算片段摩爾數(shù):pmol數(shù)= DNA量(ng)/(660×片段bp數(shù))×1000。例如:插入片段2000bp,線性載體為3000bp,如果載體使用量為50ng(0.025pmol),10μl連接體系中vector:insert的摩爾比是1:3,則需要2000bp pmol數(shù)為0.075pmol,插入片段2000bp的使用量為100ng。
2.徹底輕柔混勻后,瞬間離心,將管壁上的溶液收集到管底。
3.反應(yīng)條件:16℃孵育30分鐘。
4.可取5 μl連接產(chǎn)物熱擊轉(zhuǎn)化50 μl感受態(tài)細(xì)胞或取1-2 μl連接產(chǎn)物電擊轉(zhuǎn)化50 μl感受態(tài)細(xì)胞。
注:1)若要提高電轉(zhuǎn)實(shí)驗(yàn)效率,推薦65℃孵育10分鐘或70℃孵育5分鐘以滅活T4 DNA Ligase后,用DNA產(chǎn)物純化試劑盒或氯仿抽提對(duì)連接后的DNA片段進(jìn)行純化后才能進(jìn)行電擊轉(zhuǎn)化。
2)若要提高轉(zhuǎn)化子數(shù)目,可將連接時(shí)間延長(zhǎng)至1小時(shí)。
二 線性DNA的自身環(huán)化
1.反應(yīng)體系:
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10μl體系
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終濃度
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線性載體DNA
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x μl
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10-50 ng
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2×ligation solution MasterMix
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5 μl
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1×
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ddH2O
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up to 10 μl
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2.徹底輕柔混勻后,瞬間離心,將管壁上的溶液收集到管底。
3.反應(yīng)條件:16℃孵育30分鐘。
4.可取5 μl連接產(chǎn)物熱擊轉(zhuǎn)化50 μl感受態(tài)細(xì)胞或取1-2 μl連接產(chǎn)物電擊轉(zhuǎn)化50 μl感受態(tài)細(xì)胞。
注:1)若要提高電轉(zhuǎn)實(shí)驗(yàn)效率,推薦65℃孵育10分鐘或70℃孵育5分鐘滅活T4 DNA Ligase后,用DNA產(chǎn)物純化試劑盒或氯仿抽提對(duì)連接后的DNA片段進(jìn)行純化后才能進(jìn)行電擊轉(zhuǎn)化。
三 接頭連接
1.反應(yīng)體系:
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10μl體系
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終濃度
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線性DNA
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x μl
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100-300 ng
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磷酸化接頭
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y μl
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0.5-1 μg
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2×ligation solution MasterMix
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5 μl
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1×
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ddH2O
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up to 10 μl
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2.徹底輕柔混勻后,瞬間離心,將管壁上的溶液收集到管底。
3.反應(yīng)條件:16℃孵育30分鐘。
4.65℃孵育10分鐘或70℃孵育5分鐘滅活T4 DNA Ligase。連接產(chǎn)物可以直接進(jìn)行限制性內(nèi)切酶酶切反應(yīng)。