T4連接酶
T4 DNA ligase
貨號(hào):RTT2101
● 產(chǎn)品組成:
名稱(chēng)
|
規(guī)格
|
T4 DNA ligase (5U/μl)
|
100 U (20μl)
|
10×T4 DNA Ligation Buffer
|
0.2 ml
|
50%PEG Solution
|
0.15 ml
|
● 保存:-20℃
● 產(chǎn)品簡(jiǎn)介:
T4 DNA
Ligase 是從表達(dá)T4
DNA Ligase 基因的大腸桿菌經(jīng)誘導(dǎo)表達(dá)后分離純化而來(lái)的,催化相鄰DNA鏈的5’磷酸基團(tuán)和3’羥基基團(tuán)以磷酸二酯鍵結(jié)合反應(yīng)。該酶可催化平末端或粘性末端DNA之間的連接,還可修復(fù)雙鏈DNA、RNA、DNA/RNA雜交雙鏈中的單鏈切口。本品可應(yīng)用于DNA插入片段和載體DNA的粘性末端和平末端的連接,以及線性DNA的自身環(huán)化。
活性定義:此酶的活力單位為Weiss Unit。1個(gè)Weiss
Unit相當(dāng)于約200個(gè)粘性末端連接單位(cohesive-end
ligation unit, CEU)。1個(gè)CEU單位定義為在20 μl的連接反應(yīng)體系中,在16℃30分鐘內(nèi),能使50%的經(jīng)HindIII消化的λDNA片段連接所需的酶量。
● 注意事項(xiàng)
1.T4
DNA Ligase的最終用量不要超過(guò)推薦的用量,否則影響連接效率。
2.PEG可以極大提高平末端的連接效率,我們推薦加入終濃度為5%
PEG Solution以提高平末端的連接效率。
3.為了提高轉(zhuǎn)化效率,轉(zhuǎn)化時(shí)建議所加入連接產(chǎn)物的量不要超過(guò)感受態(tài)細(xì)胞體積的10%。
4.由于T4
DNA Ligase中含有甘油,比較粘稠容易掛壁,建議使用前短暫離心將液體收集到管底,取樣時(shí)槍頭盡量不要深入液面太深以免粘在槍頭上造成損失。
● 使用方法:
一
DNA片段和載體DNA的連接
1)粘性末端的連接
1.反應(yīng)體系:
|
10μl體系
|
終濃度
|
線性載體DNA
|
x μl
|
10-50 ng
|
插入DNA片段
|
y μl
|
插入片段:載體=1:1-5:1*
|
10×ligation
buffer
|
1 μl
|
1×
|
T4 DNA
ligase(5U/μl)
|
0.1 μl
|
0.5 U
|
ddH2O
|
up to 10 μl
|
|
*:載體與插入片段的摩爾數(shù)比需要優(yōu)化:一般vector:insert在1:1~1:5之間均可得到較好的結(jié)果。用以下公式計(jì)算片段摩爾數(shù):pmol數(shù)= DNA量(ng)/(660×片段bp數(shù))×1000。例如:插入片段2000bp,線性載體為3000bp,如果載體使用量為50ng(0.025pmol),10μl連接體系中vector:insert的摩爾比是1:3,則需要2000bp pmol數(shù)為0.075pmol,插入片段2000bp的使用量為100ng。
2.徹底輕柔混勻后,瞬間離心,將管壁上的溶液收集到管底。
3.反應(yīng)條件:16℃孵育30分鐘。
4.可取5
μl連接產(chǎn)物熱擊轉(zhuǎn)化50
μl感受態(tài)細(xì)胞或取1-2
μl連接產(chǎn)物電擊轉(zhuǎn)化50
μl感受態(tài)細(xì)胞。
注:1)若要提高電轉(zhuǎn)實(shí)驗(yàn)效率,推薦65℃孵育10分鐘或70℃孵育5分鐘以滅活T4 DNA Ligase后,用DNA產(chǎn)物純化試劑盒對(duì)連接后的DNA片段進(jìn)行純化后進(jìn)行電擊轉(zhuǎn)化。
2)若要提高轉(zhuǎn)化子數(shù)目,可將連接時(shí)間延長(zhǎng)至1小時(shí)。
3)在10
μl連接體系中若T4連接酶的終濃度大于1
U,必須對(duì)連接后的DNA片段進(jìn)行純化后方可進(jìn)行電轉(zhuǎn)。
2)平末端的連接
1.反應(yīng)體系:
|
10μl體系
|
終濃度
|
線性平末端載體DNA*
|
x μl
|
10-50 ng
|
插入DNA片段
|
y μl
|
插入片段:載體=1:1-5:1**
|
10×ligation
buffer
|
1 μl
|
1×
|
T4 DNA
ligase(5U/μl)
|
0.5 μl
|
2.5 U
|
50% PEG
solution
|
1 μl
|
5%
|
ddH2O
|
up to 10 μl
|
|
*:平滑末端的載體與 DNA 片段進(jìn)行連接時(shí),應(yīng)首先將載體進(jìn)行去磷酸化處理,以防止其自身環(huán)化。
**:載體與插入片段的摩爾數(shù)比需要優(yōu)化:一般vector:insert在1:1~1:5之間均可得到較好的結(jié)果。用以下公式計(jì)算片段摩爾數(shù):pmol數(shù)= DNA量(ng)/(660×片段bp數(shù))×1000。例如:插入片段2000bp,線性載體為3000bp,如果載體使用量為50ng(0.025pmol),10μl連接體系中vector:insert的摩爾比是1:3,則需要2000bp pmol數(shù)為0.075pmol,插入片段2000bp的使用量為100ng。
2.徹底輕柔混勻后,瞬間離心,將管壁上的溶液收集到管底。
3.反應(yīng)條件:16℃孵育30分鐘。
4.可取5
μl連接產(chǎn)物熱擊轉(zhuǎn)化50
μl感受態(tài)細(xì)胞或取1-2
μl連接產(chǎn)物電擊轉(zhuǎn)化50
μl感受態(tài)細(xì)胞。
注:1)由于平末端連接體系中,T4 ligase用量較大,若要提高電轉(zhuǎn)實(shí)驗(yàn)效率,推薦65℃孵育10分鐘或70℃孵育5分鐘以滅活T4
DNA Ligase后,用DNA產(chǎn)物純化試劑盒或氯仿抽提對(duì)連接后的DNA片段進(jìn)行純化后才能進(jìn)行電擊轉(zhuǎn)化。
2)若要提高轉(zhuǎn)化子數(shù)目,可將連接時(shí)間延長(zhǎng)至1小時(shí)。
二 線性DNA的自身環(huán)化
1.反應(yīng)體系:
|
50μl體系
|
終濃度
|
線性載體DNA
|
x μl
|
10-50 ng
|
10×ligation
buffer
|
5 μl
|
1×
|
T4 DNA
ligase(5U/μl)
|
1 μl
|
5 U
|
ddH2O
|
up to 50 μl
|
|
2.徹底輕柔混勻后,瞬間離心,將管壁上的溶液收集到管底。
3.反應(yīng)條件:16℃孵育30分鐘。
4.可取5
μl連接產(chǎn)物熱擊轉(zhuǎn)化50
μl感受態(tài)細(xì)胞或取1-2
μl連接產(chǎn)物電擊轉(zhuǎn)化50
μl感受態(tài)細(xì)胞。
注:1)若要提高電轉(zhuǎn)實(shí)驗(yàn)效率,推薦65℃孵育10分鐘或70℃孵育5分鐘滅活T4 DNA Ligase后,用DNA產(chǎn)物純化試劑盒或氯仿抽提對(duì)連接后的DNA片段進(jìn)行純化后才能進(jìn)行電擊轉(zhuǎn)化。
三 接頭連接
1.反應(yīng)體系:
|
20μl體系
|
終濃度
|
線性DNA
|
x μl
|
100-500 ng
|
磷酸化接頭
|
y μl
|
1-2 μg
|
10×ligation
buffer
|
2 μl
|
1×
|
50% PEG
solution
|
2 μl
|
5%
|
T4 DNA
ligase(5U/μl)
|
0.4 μl
|
2 U
|
ddH2O
|
up to 20 μl
|
|
2.徹底輕柔混勻后,瞬間離心,將管壁上的溶液收集到管底。
3.反應(yīng)條件:16℃孵育30分鐘。
4.65℃孵育10分鐘或70℃孵育5分鐘滅活T4
DNA Ligase。連接產(chǎn)物可以直接進(jìn)行限制性內(nèi)切酶酶切反應(yīng)。